Ученый совет является коллегиальным органом, участвующим в управлении Общецерковной аспирантурой и докторантурой. Число членов и персональный состав совета определяются Ректором, который является Председателем совета. По должности в состав Ученого совета включены проректоры, секретарь Ученого совета, заведующие кафедрами и их заместители.

Согласно Уставу ОЦАД в полномочия Ученого совета входит решение вопросов организационной структуры учебного заведения, определение направлений образовательной и научной деятельности, утверждение учебных программ, тем диссертаций, издательских планов и научных руководителей (консультантов). Кафедры ОЦАД подотчетны Ученому совету.

Работа Ученого совета проходит не только непосредственно на его заседаниях, но и между ними – на рабочих совещаниях и в переписке членов совета.

Заседания Ученого совета проводятся по решению Ректора в соответствии с его рабочим графиком.